有史赞曰：“惠帝天资仁厚。践阼之初，亲贤好学，召用方孝孺等。典章制度，锐意复古。尝因病晏朝，尹昌隆进谏，即深自引咎，宣其疏于中外。又除军卫单丁，减苏、松重赋，皆惠民之大者。乃革命而后，纪年复称洪武，嗣是子孙臣庶以纪载为嫌，草野传疑，不无讹谬。更越圣朝，得经论定，尊名壹惠，君德用彰，懿哉。”
说的是建文帝德心仁厚，登基之初，亲贤好学，启用儒家，革新军队，减轻重赋，惠及民生。朱棣革命后，复称洪武纪年，并篡改历史记录，致使草野传疑，不无讹谬。
永乐时期，官方历史掩盖了建文的年号，把明太祖的统治时期延长了四年，即从洪武32年（公元1399年）延长到洪武35年（公元1402年）。这个时期，被历史学家称之为”革除”时期。建文年号迟至万历皇帝才恢复。二百四十二年以后，，南明君主朱由崧，定朱允炆的庙号为”惠宗”，谥号为”让皇帝”。之所以选用这一尊号，是为了适应民间传说，即朱允炆并未死于宫中大火，为了解除内战的普遍苦难，而自愿逊位给他的叔父的。
到了清朝乾隆帝于公元1736年9月，封朱允炆为”恭愍惠帝”时，他的皇帝地位才完全恢复。由是，他在《明史》中，被称为“恭愍惠帝”，但在完成得更早一些的《明史稿》中，还是直截了当的被称为“朱允炆”。
建文帝和他的顾问们提倡的文官政治，与燕王发生了冲突。燕王的权力是建立在北方边境上，而且依靠的是军官们的支持；朱允炆及其左右与之不同，他们是以南京为基地，依靠的是长江下游的阶层。他们认为，像洪武时期的统治，会大大地危及王朝。因此，他们相信只有提高儒家价值观和文官的权威，去掉半自治的藩封王子，才能使之得到纠正。但是，他们没有成功，因为他们没有多少实际经验，在战场上，缺乏果断的领导，周密的计划，首尾一贯的战略方针。
这次内战，对于明王朝所产生的结果，已经超出了争夺帝位的阋墙之争。洪武朝封建半自治的藩王，已经对王朝的稳定造成了严重的威胁。朱棣死后，新皇帝再一次提倡儒家关于文官政府的原则，并在洪熙和宣德两朝取得了具体结果。
在通俗性的历史著作中，建文之治通过关于这位命途多舛的皇帝的大量传奇故事，受到人们的怀念。这些传奇之所以产生，是人们同情他的苦难遭遇，以及被他有神秘色彩的命运所吸引。这些传说之所以形成，是因为人们相信，南京陷落时，建文帝并没有死于宫中的大火，而是乔装成和尚，逃离了京师，以致后来的情节变得越来越复杂了。
英宗正统五年（公元1440年）末，一个稀奇古怪的事件，表明了这个传说有多少人信以为真。有一个九十岁的老和尚，利用这个传说，来到了正统皇帝的朝廷，自称他是从前的皇帝。这个骗子后来被揭露并处死了，但这个事件却助长了人们的幻想，也激发了其他相关传说的产生。
在十六世纪以后，关于这个题材的小说演义中，朱允炆和他的殉难随从人员，都逐渐变成了悲剧式的英雄人物。这些作品把这位皇帝描写成为一位勤于政事和仁慈的君主，对他的叔父慷慨大度，并自动地提出把皇位让给了后者。
人们还渲染一个故事，说在京师失守之日，他逃脱了叛变者的耳目，当了一位高寿的和尚，死后仍然留有后代。人们也同情地描述建文的殉节者，如齐泰、黄子澄和方孝孺，说他们是忠臣义士，声称他们的身后也仍有许多后嗣，尽管他们受到迫害。这些无奇不有的传奇故事，不仅反映了人们对朱允炆及其所信奉的理想的同情。
说朱允炆自动地让位给燕王，这种故事越来越受到人们的欢迎。此说甚至被郑晓（公元1499—1566年）认为，是有可信的历史真实性，并把它收于他的《建文逊国记》（约公元1566年）中。因此助长了人们给朱允炆重新树立形象的心理，并导致在万历二十三年（公元1595年）正式恢复了他的年号的行动。
关于建文朝代的传闻轶事，在下一个世纪仍然不断地出现。这些传说，变成了人们发泄压抑情绪的通风口，是人们在极权统治下，对要求仁慈和正义的呼吁。人们不仅戏剧化了这位皇帝的事迹，使他成了悲剧式的人物。由于人们进一步想纠正不公，他们谴责永乐皇帝及其支持者，是一伙叛贼和恶棍。
人民群众对这位前皇帝的同情是如此普遍，致使他被明末清初的许多造反领袖所利用，他们都伪称自己是他的合法后代。
在学者精英阶层中，从明代中末叶起，也一直增长着这种谴责永乐皇帝的倾向。清朝乾隆皇帝在乾隆元年（公元1736年），决定恢复朱允炆的合法地位，其大部分原因便是士大夫精英怀有这样的情绪。
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